Phù Thủy Học Đường - The Craft Legacy kể về cô gái Lily xinh đẹp và thông mình, cô đã chuyển đến một ngôi trường mới tại thị trấn nhỏ. Thế nhưng, tại đây cô gặp vô số những rắc rối và toàn bị bạn bè chơi khăm. Sau đó, cô đã được 3 người bạn phù thủy đề nghị gia nhập nhóm và cô đã vui vẻ đồng ý. Sau đó cả nhóm đã thực hiện một nghi lễ và nhận được phép thuật, nhưng cả nhóm lại không thể kiếm soát hoàn hảo sức mạnh này. Thế nhưng, họ không biết rằng sức mạnh đne tối này ẩn chứa những điều nguy hiểm. Liệu bọn hộ sẽ làm thế nào để có thể đối mặt với chúng?
