Vỏ Bọc Ma: SAC_2045 Chiến Tranh Trường Kỳ - Ghost in the Shell: SAC_2045 Sustainable War lấy bối cảnh diễn ra vào tương lai năm 2045. Khi lúc này nền kinh tế thế giới đang sụp đỗ, và bắt đầu bước vào một cuộc chiến sống còn cùng với các mối đe dọa mới. Kusanagi Motoko và các thành viên trong biệt đội được tổ chúc cho nhiệm vụ đối phó với kẻ tội phạm mạng.
